GnRH-a的副作用其实就是由它所引起的女性体内低雌激素状态所带来的，其副作用与围绝经期症状如出一辙，主要表现为阴道干涩、潮热、失眠、易怒、抑郁、记忆力减退等等，长期应用GnRH-a后过低的雌激素水平还会引起骨质疏松和心血管问题。

所以在给予GnRH-a治疗时，医生都会补充一点点雌激素来预防和缓解这些围绝经期症状。

对于卵巢功能正常的女性来说，GnRH-a的效应大概在停药2+个月后就慢慢消失，垂体和卵巢的功能都会逐渐恢复，卵巢苏醒后其功能不会受到影响，但是长期用药造成的骨质丢失却常常是无法完全恢复的。

对于卵巢功能减退的女性来说，GnRH-a的作用可能会对卵巢的压制更大，个别患者甚至会出现卵巢“一睡不醒”的情况。

因此，对于卵巢功能减退的女性来说，GnRH-a的使用应更为慎重。