甲亢引起的性腺功能紊乱，与其严重程度密切相关，轻度甲亢在起病之初，大多数月经周期无改变；随后卵巢内分泌功能受影响，雌孕激素分泌和释放增多，导致子宫内膜增生过长，出现月经过多过频，引发功能失调性子宫出血，痛经及经前紧张综合症等；

甲亢发展至中重度时，导致性激素分泌紊乱和排卵障碍，引起月经稀发，月经量减少，闭经，甚至不孕不育。

甲亢发生在青春期前，会影响性成熟，但身体发育正常，青春期后发生会影响生殖功能，月经周期延长或缩短，经量可减少，生育率下降，流产率增高。

如果怀孕后甲状腺功能控制不好，孕期还容易发生“甲状腺危象”，有生命危险呢。

甲减时，甲状腺激素分泌减少，对促甲状腺激素释放激素( TRH) 和促甲状腺激素（TSH）的反馈抑制作用减弱，可引起高泌乳素血症( PRL) ，导致月经过多、月经稀发、闭经、流产或不孕等。如果出生后即发生甲减，则发生性成熟延迟。

研究表明，甲减与不孕症密切相关。一般人群中的育龄期女性的甲减患病率约2%～4%，近期的一项研究结果显示，394例不孕患者中，23.9%为甲减或亚临床甲减，76%的甲减患者在治疗后1年内成功自然妊娠。

抗甲状腺过氧化物酶抗体( TPOAb) 、甲状腺球蛋白抗体( TGAb) 及TSH 受体抗体( TRAb) 是甲状腺自身免疫功能亢进的标志。多囊卵巢综合症和子宫内膜异位症常伴有甲状腺自身免疫的异常，建议对不孕女性，尤其是患有子宫内膜异位症或PCOS的患者筛查甲功和甲状腺自身免疫抗体，必要时予以处理。