阴道免疫功能是全身免疫的重要组成部分，当病原体攻击阴道黏膜时，除阴道产生免疫反应外，血液和其他器官黏膜部位很快产生免疫应答，参与防止阴道感染。阴道微生态失衡可激活机体免疫系统，产生多种炎性因子，使机体处于慢性炎症状态，导致女性不孕症的发生。

维持阴道微生态平衡是通过各种直接和间接的防御机制实现的，例如产生直接杀死或抑制病菌的化合物、形成抵抗病原体黏附的物理屏障，以及刺激机体防御机制。尽管有抗生素的作用，但不能用来改变阴道微生物群，但对于由病原体引起的感染，一方面应按照诊治指南，进行针对的药物治疗，另一方面可口服或阴道使用益生菌调节阴道菌群，维持阴道的酸性环境，还可避免抗生素滥用和长期使用抗菌药物引起的菌群失调。

阴道微生物群是一个以乳杆菌为主的群落，阴道微生物群对于维持宿主的正常生理环境至关重要。阴道微生态失衡不仅会引起生殖道感染，还引起不孕症。及时干预，对于保护和改善其生育能力有重要的意义，建议将阴道菌群筛查作为所有女性的常规筛查，尤其是接受不孕症治疗的女性。