按照人类理想，自然周期的试管婴儿才是辅助生殖技术发展的终极目标，但目前它还没有成为常规和主流的助孕方案，需要继续积累经验。

目前采用自然周期最多的还是高龄女性。高龄女性，尤其在35岁以后，更容易出现卵母细胞数量和质量下降，即使做试管婴儿成功率也会较低。因为卵巢中卵子数目减少，大剂量的药物刺激也不能提高卵子数和妊娠率，自然周期凸显了优势，可以获得相似的妊娠率。

患有激素依赖性疾病或肿瘤的患者，对患乳腺癌、系统性红斑狼疮疾病的女性，由于超促排卵可能诱发疾病，自然周期的生理激素水平，在这类人群比较安全。

反复IVF治疗失败的患者，对于某些常规方案试管婴儿反复失败的患者，无刺激的自然周期常常减轻卵巢的负担，可能提高卵子的质量。

年轻卵巢功能好的女性，这类患者是试管婴儿最容易成功的对象，不孕的原因常常是男方因素，或者是输卵管因素。高质量的卵子容易获得，实际上1个卵子就够怀孕了，无需刺激一大堆卵子出来，众多胚胎长期冷冻不见天日，这是一种很大的浪费。