胚胎期（器官形成期）
此阶段为高度敏感期，受精后14~56天，即停经后28~70天。

此阶段细胞分化迅速，胚胎各器官处于发育、形成阶段。如果受到有害药物作用，细胞不易分化代偿修复，极易发生形态上的异常，可出现严重的结构畸形。

不同系统和器官的形成和发育不完全同步，大多数器官对致畸作用有特殊敏感期：

中枢系统于受孕15～25天

心脏于受孕20～40天

四肢于受孕24～46天
此阶造成的影响是重要的先天异常，例如无肢胎儿（没胳膊没腿）。

比如，20世纪50至60年代初期在全世界广泛使用的沙利度胺（反应停），能够有效地阻止女性怀孕早期的呕吐，但也妨碍了孕妇对胎儿的血液供应。因此，该药物在当时造成了大量“海豹畸形婴儿”出生。

胎儿期（器官形成已结束）
此阶段是从妊娠56～58天开始，直至分娩。
妊娠3个月后，大部分的器官已经形成，致畸的药物对多数器官影响较弱，造成畸形的可能性相对较小。但对于需要较长时间分化、发育完善的器官（生殖器官、中枢系统等）可产生影响，如耳聋、失明、智力低下等中枢神经系统的损害。

此阶段的胎儿“硬件”大部分已经发育成熟，受到的影响较小，大多出现功能缺陷以及微小的异常。

因此对于服药后发现怀孕时，不要过度惊慌，药物对胎儿的影响需要根据用药时间、胎龄、药物性质等多方面综合因素进行评估。
值得一提的是关于出生缺陷问题，药物并不是主要原因，结构畸形和功能缺陷往往还包含人类自身的基因缺陷、外界环境因素以及未知因素等众多因素共同造成的结果。
例如我家里的长辈，两个舅舅是色盲，但是两个姨和我妈都没有这方面的缺陷。
很多出生缺陷的原因是说不清楚的，更多的可能还是基因问题和环境因素共同引起的。因此任何人都不能保证孩子出生百分百的没有问题，只能通过各项检查来适当的降低出生缺陷发生的几率。