ICSI通过人为选择精子，直接注射入卵子完成受精，缺乏精子的自然选择过程，属于“强求的缘分”，违反了自然规律，因此ICSI的子代安全性一直受到广泛的关注和讨论。在该技术问世早期，因为临床的迫切需求，并没有非常坚实的动物实验基础证据，也缺乏对人类的长期预后观察。目前的研究显示ICSI技术是相对安全的。

2016年一项权威荟萃分析，随访并比较了ICSI和常规IVF婴儿出生后的情况，发现在神经发育、生长指标、一般健康状况和儿童肿瘤等方面两者无明显差异。但通过ICSI出生的孩子自闭症和智力障碍的风险增加。

另有荟萃分析随访比较了ICSI和自然受孕婴儿的出生后情况，发现在神经发育、生长、视觉和听力方面两者无差异。但通过ICSI出生的孩子肥胖和胰岛素抵抗等风险增加，这可能与亲代本身存在的健康问题有关。

有的研究也提示，男性因素不育，特别是重度少弱畸精子症，男性子代尿道下裂畸形率升高。不过，这个数据还在严密随访之中。

试管婴儿的目标不仅仅是“抱宝宝回家”，更要孕育健康的下一代。相信在全球科研和医疗工作者的不懈努力下，辅助生殖技术一定会越来越完善，为人类“孕育”一个美好的明天！