子宫因素
子宫、输卵管结构/功能异常，临床研究统计，子宫纵隔、宫腔粘连、内膜息肉、粘膜下子宫肌瘤等各种病变，都会一定程度地降低胚胎着床率。反复种植失败的患者会首先接受宫腔镜评估。

盆腔炎症，合并输卵管积水，也可能会干扰着床。通常先处理积水，再进行试管婴儿治疗。

子宫内膜容受性，子宫内膜的厚度和容受性，是胚胎植入并获得妊娠的关键条件，种植窗时期，子宫内膜上皮发生一系列分化，以适应胚胎种植的需要。但是子宫内膜容受性的界定是很难的，缺少金标准的指标，有时非常难以鉴定。 

全身因素
内分泌因素
如多囊卵巢综合征、高胰岛素血症、高雄激素血症、高泌乳素血症、甲状腺功能异常等。 目前比较肯定的是，没有控制的糖尿病、胰岛素抵抗、肥胖的患者，复发性流产率是增加的，而着床失败是流产的早期的序贯表现，推测和胚胎着床机制难脱干系。

血栓前状态
凝血机制异常导致胎盘局部微血栓形成甚至引起胎盘梗死，胚胎缺血缺氧，胚胎着床几率下降，流产风险增高。

免疫因素
自身免疫性疾病如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、甲状腺自身抗体阳性等。封闭抗体的检测和治疗目前尚存在争议。
其它因素
环境、情绪、营养等因素。 尽管临床方案的优化和实验室技术的巨大进步，胚胎着床失败仍然是一个临床医生和胚胎学家普遍面临的重大挑战。

试管婴儿一次能不能成功，或者几次能成功，是没有人能够准确预测的。除了与医疗技术、实验室培养条件、患者的年龄、病因、体质、子宫内膜环境等等之外，还有一些不可预见或是不明原因的因素。并非年轻女性一定能够一次成功，也并非高龄女性求子的道路就注定坎坷。