在绝大多数情况下，因为避孕药是非处方药，给正常人服用避孕的，不能允许有明显的副作用，是非常安全的。如果是针对治疗疾病，在专业医生的指导下使用也是没有问题的。研究已经证明了药物本身对胎儿没有致畸作用，停药即可怀孕。对于健康妇女避孕，长期使用COC还能降低卵巢癌、子宫内膜癌、和结直肠癌的发生风险。
但是，COC也可能存在着一些很低的风险，因为是雌孕激素，对乳腺有所刺激，长期服用可能轻微增加乳腺癌的风险；轻微增加某些已感染HPV的妇女发生子宫颈癌的风险，对HPV阴性的妇女并无影响。更重要的是，COC可能促进血栓形成，因此对有血栓家族史的女性要小心。对于高龄、吸烟、肥胖、高血压、脂代谢异常、血栓疾病史等高危因素存在的女性，如需使用COC，一定要经过医生的全面评估并谨遵医嘱使用。而对于产后<6个月的哺乳期女性、心血管疾病、WHO2-3级的高脂血症、无先兆偏头痛、确诊的乳腺癌、胆囊疾病史等的女性，禁止使用COC。
综上所述，对于大多数女性，复方口服避孕药都是安全、可靠的。除了避孕，其还能在多种疾病中发挥重要的治疗和辅助治疗作用。但是，我们也不能忽视其存在的潜在风险，用药时应与医生充分沟通并规范使用，力求获益最大，风险最小。