怀孕早期孕酮水平低可能是由多种因素引起的，以下是一些可能导致孕酮水平低的原因：

黄体功能不全：黄体功能不全是指黄体产生的孕酮不足以维持怀孕。这可能是由于黄体组织功能异常、黄体早期衰退或卵巢问题引起的。

黄体囊肿：黄体囊肿是一种卵巢的囊性病变，它可能干扰正常的黄体功能，导致孕酮水平下降。

胚胎问题：如果胚胎本身存在问题，可能会导致孕酮水平下降，因为正常的胚胎对黄体产生孕酮有重要作用。

卵巢问题：卵巢问题，如多囊卵巢综合症（PCOS），可能会干扰正常的黄体形成和功能，导致孕酮水平降低。

荷尔蒙失调：体内荷尔蒙失调，特别是促黄体生成激素（LH）和卵泡刺激激素（FSH）的比例失调，也可能影响孕酮的产生。