多胎妊娠对胎儿及新生儿而言，易发生低体重儿、胎儿生长受限、胎儿宫内发育迟缓、早产、脑瘫、中枢神经系统发育异常等不良结局。
单胎妊娠平均孕龄39周，双胎妊娠为35周，三胎妊娠为32周，四胎妊娠仅为29周。早产可导致新生儿死亡率增高，1996年美国新生儿死亡中16%为多胎妊娠，在出生第1年内多胎妊娠儿死亡的可能性为单胎妊娠的7倍。
多胎妊娠胎儿畸形的发生率也明显高于单胎妊娠，是单胎胎儿的2倍（4%~7%）。国外学者对ART多胎妊娠进行调查，ART多胎妊娠的并发症较自然多胎妊娠的并发症发生率高，也加高于ART单胎妊娠。

多胎妊娠在妊娠期并发症多、产前需住院的时间延长，同时多胎妊娠孕妇的剖宫产比例也较单胎妊娠孕妇明显升高，西方国家平均单胎剖宫产率为25% ，双胎的剖宫产率为59%，三胎妊娠的剖宫产率几乎为87%～100%，孕妇生产的医疗费用增长。
多个孩子的抚养、教育等费用成倍增加；
对出现脑瘫、智力障碍、畸形和残疾等远期并发症远未可预知，其抚养、治疗、护理更加是家庭和社会的沉重负担。